ENCAP: Computational prediction of tumor T cell antigens with ensemble classifiers and diverse sequence features，PLoS One SCI 2024 游荏捷(Jen-Chieh Yu)、倪寬(Kuan Ni)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)*
Improved Prediction of Anti-Angiogenic Peptides Based on Machine Learning Models and Comprehensive Features from Peptide Sequences，Scientific Reports, vol.14 no.1 pp.14387- SCI 2024 李昀蓁(Yun-Chen Lee)、游荏捷(Jen-Chieh Yu)、倪寬(Kuan Ni)、林育全(Yu-Chuan Lin)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)*
Unlocking the Secrets Behind Advanced Artificial Intelligence Language Models in Deidentifying Chinese-English Mixed Clinical Text: Development and Validation Study，JOURNAL OF MEDICAL INTERNET RESEARCH, vol.26 no.e48443 pp.1-22 SCI 2024 You-Qian Lee、陳鯨太(Ching-Tai Chen)、Chien-Chang Chen、Chung-Hong Lee、Peitsz Chen、Chi-Shin Wu、Hong-Jie Dai(Hong-Jie Dai)*
Improving quantitation accuracy in isobaric-labeling mass spectrometry experiments with spectral library searching and feature-based peptide-spectrum match filter，Scientific Reports SCI 2023 Tzu-Yun Kuo、Jen-Hung Wang、Yung-Wen Huang、宋定懿(Ting-Yi Sung)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)*
Calibr improves spectral library search for spectrum-centric analysis of data independent acquisition proteomics，Scientific Reports SCI 2022 王人弘(Jen-Hung Wang)、鍾偉國(Wai-Kok Choong)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)*、宋定懿(Ting-Yi Sung)
Multi-Q 2 software facilitates isobaric labeling quantitation analysis with improved accuracy and coverage，Scientific Reports, vol.11 no.1 pp.1-12 SCI 2021 陳鯨太(Ching-Tai Chen)、王人弘(Jen-Hung Wang)、鄭成偉(Cheng-Wei Cheng)、許維哲(Wei-Che Hsu)、柯筑苓(Chu-Ling Ko)、鍾偉國(Wai-Kok Choong)、宋定懿(Ting-Yi Sung)*
Sequence-based Prediction of Antimicrobial Peptides with CatBoost Classifier - The 22nd IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering Taichung, Taiwan 2022.11 游荏捷(Jen-Chieh Yu)、倪寬(Kuan Ni)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)
使用人工智慧以及資料導向方法以提升標記化蛋白質體定量準確性 (MOST 110-2222-E-468-003) 2021.09.01 ~ 2023.08.31 陳鯨太(Ching-Tai Chen)、宋定懿(Ting-Yi Sung)
基礎程式設計 EB301066B (大學日間部 )【第113學年第1學期：B班】<br>本課程以Python程式語言為主，教導學生具備運算思維進行程式撰寫，課程內容包含：資料輸出入、資料處理、模組應用、邏輯控制等，配合電腦實機練習以利學生學習。本課程涵蓋學習Python程式語言的基礎部分，包含運算思維、基本資料型態、基本輸入與輸出、流程控制、迴圈與函數設計等課程內容。本課程是屬於實用型。
基礎程式設計 EB301066A (大學日間部 )【第113學年第1學期：A班】<br>本課程以Python程式語言為主，教導學生具備運算思維進行程式撰寫，課程內容包含：資料輸出入、資料處理、模組應用、邏輯控制等，配合電腦實機練習以利學生學習。本課程涵蓋學習Python程式語言的基礎部分，包含運算思維、基本資料型態、基本輸入與輸出、流程控制、迴圈與函數設計等課程內容。本課程是屬於實用型。
生醫資訊與醫工概論 EB300977A (大學日間部 )【第113學年第1學期：A班】<br>讓學生對生醫資訊與醫學工程在各方面的發展有概略性的了解，能確切了解就讀本系後的未來發展方向。同時讓學生了解資訊與醫學倫理的重要性。本課程是屬於研究型。
離散數學 EB300171A (大學日間部 )【第113學年第1學期：A班】<br>學生必須學會一組特定的數學事實，並知道如何去應用;更重要地，這樣的課程應該能夠教導學生如何用邏輯與數學思考。本課程是屬於學術型。
類神經網路 EB200980A (研究所碩士班 )【第113學年第1學期：A班】<br>認知層面著重於發展學生對神經網絡運作方式的理解，包括學習、決策和模式識別的過程。認知教學策略旨在透過鼓勵學生探索人工網絡模擬人類大腦認知某些方面的方式，來增強他們的批判性思考和問題解決能力。這包括理解網絡如何從數據中學習（使用反向傳播等技術），如何推廣到未知的例子，以及不同架構（如MLP、CNN或RNN）如何適合各種任務。