ENCAP: Computational prediction of tumor T cell antigens with ensemble classifiers and diverse sequence features，PLoS One SCI 2024 游荏捷(Jen-Chieh Yu)、倪寬(Kuan Ni)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)*
Improved Prediction of Anti-Angiogenic Peptides Based on Machine Learning Models and Comprehensive Features from Peptide Sequences，Scientific Reports, vol.14 no.1 pp.14387- SCI 2024 李昀蓁(Yun-Chen Lee)、游荏捷(Jen-Chieh Yu)、倪寬(Kuan Ni)、林育全(Yu-Chuan Lin)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)*
Unlocking the Secrets Behind Advanced Artificial Intelligence Language Models in Deidentifying Chinese-English Mixed Clinical Text: Development and Validation Study，JOURNAL OF MEDICAL INTERNET RESEARCH, vol.26 no.e48443 pp.1-22 SCI 2024 You-Qian Lee、陳鯨太(Ching-Tai Chen)、Chien-Chang Chen、Chung-Hong Lee、Peitsz Chen、Chi-Shin Wu、Hong-Jie Dai(Hong-Jie Dai)*
Improving quantitation accuracy in isobaric-labeling mass spectrometry experiments with spectral library searching and feature-based peptide-spectrum match filter，Scientific Reports SCI 2023 Tzu-Yun Kuo、Jen-Hung Wang、Yung-Wen Huang、宋定懿(Ting-Yi Sung)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)*
Calibr improves spectral library search for spectrum-centric analysis of data independent acquisition proteomics，Scientific Reports SCI 2022 王人弘(Jen-Hung Wang)、鍾偉國(Wai-Kok Choong)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)*、宋定懿(Ting-Yi Sung)
Multi-Q 2 software facilitates isobaric labeling quantitation analysis with improved accuracy and coverage，Scientific Reports, vol.11 no.1 pp.1-12 SCI 2021 陳鯨太(Ching-Tai Chen)、王人弘(Jen-Hung Wang)、鄭成偉(Cheng-Wei Cheng)、許維哲(Wei-Che Hsu)、柯筑苓(Chu-Ling Ko)、鍾偉國(Wai-Kok Choong)、宋定懿(Ting-Yi Sung)*
Sequence-based Prediction of Antimicrobial Peptides with CatBoost Classifier - The 22nd IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering Taichung, Taiwan 2022.11 游荏捷(Jen-Chieh Yu)、倪寬(Kuan Ni)、陳鯨太(Ching-Tai Chen)
使用人工智慧以及資料導向方法以提升標記化蛋白質體定量準確性 (MOST 110-2222-E-468-003) 2021.09.01 ~ 2023.08.31 陳鯨太(Ching-Tai Chen)、宋定懿(Ting-Yi Sung)
基礎程式設計 EB301066B (大學日間部 )【第113學年第1學期：B班】<br>本課程以Python程式語言為主，教導學生具備運算思維進行程式撰寫，課程內容包含：資料輸出入、資料處理、模組應用、邏輯控制等，配合電腦實機練習以利學生學習。本課程涵蓋學習Python程式語言的基礎部分，包含運算思維、基本資料型態、基本輸入與輸出、流程控制、迴圈與函數設計等課程內容。本課程是屬於實用型。
基礎程式設計 EB301066A (大學日間部 )【第113學年第1學期：A班】<br>本課程以Python程式語言為主，教導學生具備運算思維進行程式撰寫，課程內容包含：資料輸出入、資料處理、模組應用、邏輯控制等，配合電腦實機練習以利學生學習。本課程涵蓋學習Python程式語言的基礎部分，包含運算思維、基本資料型態、基本輸入與輸出、流程控制、迴圈與函數設計等課程內容。本課程是屬於實用型。
生醫資訊與醫工概論 EB300977A (大學日間部 )【第113學年第1學期：A班】<br>讓學生對生醫資訊與醫學工程在各方面的發展有概略性的了解，能確切了解就讀本系後的未來發展方向。同時讓學生了解資訊與醫學倫理的重要性。本課程是屬於研究型。
離散數學 EB300171A (大學日間部 )【第113學年第1學期：A班】<br>學生必須學會一組特定的數學事實，並知道如何去應用;更重要地，這樣的課程應該能夠教導學生如何用邏輯與數學思考。本課程是屬於學術型。